Jurnal Internasional Unsur transposable inverted-repeat miniatur, AddIn-MITE, yang terletak di dalam gen WD40 dilestarikan dalam rumput Andropogoneae

Download Jurnal Disini

Unsur-unsur transposable inverted-repeat (MITE) miniatur telah dikaitkan dengan wilayah gen dalam genom tanaman dan dapat memainkan peran penting dalam pengaturan gen terdekat melalui perekrutan RNA kecil (sRNA) ke lokus MITE. Kami mengidentifikasi delapan keluarga Tungau dalam perakitan genom tebu dengan pipa TAMBANG-Hunter. Urutan-urutan ini ditemukan hulu, hilir atau dimasukkan ke dalam 67 wilayah genom dalam genom. Posisi Tungau yang paling melimpah (mirip Stowaway) di kawasan genik, yang kami sebut AddIn-MITE, dikonfirmasi dalam gen WD40. Analisis empat spesies monokotil menunjukkan konservasi sekuens AddIn-MITE, dengan sejumlah besar salinan dalam genomnya. Kami juga menyelidiki konservasi posisi AddIn-MITE dalam gen WD40 dari sorgum, jagung dan, pada tanaman tebu dan spesies Saccharum liar. Di semua pabrik yang dianalisis, AddIn-MITE telah berlokasi di wilayah intron WD40. Lebih lanjut, peran sRNA yang terkait dengan AddIn-MITE dalam wilayah genetika WD40 diselidiki. Kami menemukan sRNA yang dipetakan secara khusus ke AddIn-MITE daripada wilayah lain pada gen WD40 dalam tebu. Selain itu, analisis pola distribusi RNA kecil pada gen WD40 dan struktur AddIn-MITE, menunjukkan bahwa wilayah Tungau adalah lokus proto-miRNA di tebu. Bersama-sama, data ini memberikan wawasan tentang peran AddIn-MITE dalam rumput Andropogoneae.

Download Jurnal Disini
Jurnal

Unsur transposable inverted-repeat miniatur, AddIn-MITE, yang terletak di dalam gen WD40 dilestarikan dalam rumput Andropogoneae