Jurnal Internasional Tanaman, Vol. 7, Halaman 71: Analisis Proteom dari Respon Root Rapeseed terhadap Stres Waterlogging

Download Jurnal Disini

Tanaman, Vol. 7, Halaman 71: Analisis Proteom dari Respon Root Rapeseed terhadap Waterlogging Stres

Tanaman doi: 10.3390 / plants7030071

Penulis:
Jinsong Xu
Xing Qiao
Zhitao Tian
Xuekun Zhang
Xiling Zou
Yong Cheng
Guangyuan Lu
Liu Zeng
Guiping Fu
Xiaoyu Ding
Yan Lv

Kesehatan tanaman secara keseluruhan dipengaruhi secara konstan oleh lingkungan yang berubah dan tidak bersahabat. Karena perubahan iklim dan pola pertanian padi (Oryza sativa) dan rapeseed (Brassica napus L.), stres akibat genangan air menimbulkan ancaman serius terhadap jaminan produktivitas dan hasil rapeseed di cekungan Sungai Yangtze China. Untuk meningkatkan pemahaman kita tentang mekanisme yang kompleks di balik genangan air dan mengidentifikasi genangan air yang responsif terhadap air, pertama-tama kita melakukan iTRAQ (tag isobarik untuk kuantifikasi relatif dan absolut) analisis proteomik kuantitatif berbasis akar rapeseed di bawah perlakuan waterlogging, baik untuk kultivar toleran ZS9 dan kultivar GH01 sensitif. Sebanyak 7736 protein diidentifikasi oleh iTRAQ, yang beberapa ratus menunjukkan tingkat ekspresi yang berbeda, termasuk 233, 365, dan 326 setelah stres genangan air untuk 4H, 8H, dan 12H di ZS9, masing-masing, dan 143, 175, dan 374 setelah genangan air stres untuk 4H, 8H, dan 12H di GH01, masing-masing. Untuk protein yang berulang kali diidentifikasi pada titik waktu yang berbeda, analisis gen ontologi (GO) klaster menunjukkan bahwa protein responsif dari kedua kultivar keduanya diperkaya dalam proses biologis transkripsi bergantung DNA dan proses oksidasi & reduksi, dan respon terhadap berbagai stres dan stimulus hormon, sementara frekuensi distribusi yang berbeda dalam dua kultivar diselidiki. Selain itu, protein tumpang tindih dengan kecenderungan yang sama atau berlawanan dari perubahan lipatan antara ZS9 dan GH01 diamati dan dikelompokkan berdasarkan rasio ekspresi yang berbeda, menunjukkan dua kultivar genotipe menunjukkan mekanisme molekuler diversiform atau jalur regulasi dalam respons stres genangan air mereka. Hasil reaksi QRT-PCR (kuantitatif real-time polymerase chain reaction) yang teridentifikasi protein kandidat pada tingkat transkripsi, yang disiapkan untuk penelitian lebih lanjut. Kesimpulannya, protein yang terdeteksi dalam penelitian ini mungkin melakukan fungsi yang berbeda dalam respon genangan air dan akan memberikan informasi yang kondusif untuk lebih memahami mekanisme adaptif di bawah tekanan lingkungan.

Download Jurnal Disini
Jurnal

Tanaman, Vol. 7, Halaman 71: Analisis Proteom dari Respon Root Rapeseed terhadap Stres Waterlogging