Jurnal Internasional Primer baru untuk metabarcoding isi usus laba-laba

No view

Download Jurnal Disini

Sebagai kelompok predator utama, laba-laba telah menerima banyak perhatian oleh ahli ekologi web makanan di berbagai bidang seperti pengendalian hama, transfer polutan, dan fluks lintas ekosistem. Kesulitan yang terlibat dalam mempelajari diet mereka telah menyebabkan penggunaan teknologi baru seperti metabarcoding isi usus. Amplifikasi berbagai mangsa laba-laba tanpa memperkuat laba-laba itu sendiri adalah suatu tantangan dan, sampai sekarang, primer universal yang efisien yang ditujukan untuk hal ini belum ada.
        Kami mengembangkan novel forward primer (NoSpi2) yang menargetkan gen subunit I sitokrom c oksidase. Primer dirancang untuk tidak memperkuat laba-laba clade calamistrum oval (Lycosidae dan spesies terkait erat) sementara masih memperkuat sebagian besar invertebrata lainnya. NoSpi2 diuji bersama dengan primer terbalik BR2 dalam silico, in vitro pada spesimen tunggal mangsa dan laba-laba, pada komunitas perangkap mock dan malaise, dan dalam aplikasi ekologis.
        Dalam evaluasi silico diprediksi bias primer tinggi untuk laba-laba clade calamistrum oval dan bias rendah untuk semua invertebrata lainnya. Hasil ini sebagian besar dikonfirmasi oleh tes in vitro. Selain itu, beberapa keluarga laba-laba tidak diperkuat bertentangan dengan harapan kami. Kami menunjukkan efisiensi tinggi untuk pasangan primer NoSpi2 / BR2 yang memulihkan hingga 94% taksa di komunitas tiruan dan 85% taksa terdeteksi oleh pasangan primer invertebrata terbaik yang dikenal (BF3 + BR2) untuk komunitas perangkap malaise. Eksperimen lapangan menunjukkan bahwa DNA laba-laba Lycosidae tidak diperkuat oleh set primer NoSpi2. Ini juga menunjukkan berbagai spesies mangsa yang terdeteksi. Kami menemukan mangsa dari 12 ordo, 67 famili dan 117 spesies.
        Kemampuan kombinasi primer NoSpi2 / BR2 untuk menguatkan spesies mangsa secara andal, tanpa memperkuat predator apa pun, menjadikannya pilihan ideal untuk analisis isi usus untuk spesies laba-laba lycosid dan spesies terkait erat, bahkan memungkinkan homogenisasi seluruh spesimen laba-laba tanpa pembedahan. Mengingat bahwa spesies mangsa yang terdeteksi termasuk laba-laba lain dan kumbang kumbang, primer ini dapat digunakan tidak hanya untuk studi diet dan kontrol biologis, tetapi juga untuk mempelajari predasi intra-guild.

Download Jurnal Disini
Jurnal

Primer baru untuk metabarcoding isi usus laba-laba