Jurnal Internasional Polimorfisme genetik pada protein heat-shock protein 70 dan variasi d-loop DNA mitokondria: implikasi pada pemilihan stres panas pada ayam asli di Kenya

Download Jurnal Disini

Latar Belakang: Perubahan iklim yang mengakibatkan stres panas, adalah salah satu kondisi lingkungan yang paling menantang yang mempengaruhi unggas. Mempelajari thermotolerance sangat penting dalam pencegahan stres panas pada ayam karena dapat menyebabkan identifikasi garis genetik yang dapat menahan efek buruk dari stres panas. Penelitian ini bertujuan untuk menyelidiki polimorfisme pada gen heat shock protein 70 (HSP70) pada ekotip ayam asli. Kami juga menganalisis DNA D-loop mitokondria (mtDNA) ayam asli untuk menilai asal-usul dan keragaman genetiknya.
        Metode: Kami mengumpulkan sampel Dari Cekungan Turkana, Mt. DAS Elgon, Danau Victoria, dan ekotipe ayam Lamu di Kenya. DNA genom diekstraksi dari 280 sampel ayam. Wilayah 360 bp pertama dari HSP70 dan wilayah 760 bp pertama dari mtDNA kemudian diamplifikasi melalui PCR. Ini kemudian diurutkan menggunakan metode Sanger ABI 3730.
        Hasil: Kami mengungkapkan melalui analisis terperinci dari fragmen gen HSP70 pada 20 ekor ayam asli dengan adanya tiga haplotipe HSP70 (GC, AC, dan AG) dan haplotipe 28 mtDNA. Analisis filogenetik HSP70 mengungkapkan adanya haplotipe leluhur GC yang mendominasi ekotipe cekungan Turkana. Haplotipe 28 mtDNA berkerumun di haplogroup A, B, C, D, E, dan I. Haplogroup E yang belum pernah dilaporkan pada ayam komersial yang didominasi dalam ekotipe cekungan Turkana menunjukkan tidak ada pencampuran dengan ayam komersial. haplogroup mtDNA terbukti berasal dari berbagai bagian Asia Selatan dan Tenggara. Kurangnya struktur populasi dalam ekotip ayam asli dapat menjadi indikasi pencampuran genetik. Indeks keanekaragaman nukleotida dan haplotipe mtDNA rendah untuk ekotipe cekungan Turkana dan tinggi untuk ekotipe Lamu. Indeks keanekaragaman nukleotida HSP70 yang tinggi dicatat dalam ekotipe cekungan Turkana, sedangkan nilai rendah dicatat dalam ekotipe Lamu. Sebagian besar variasi genetik mtDNA terjadi di dalam individu untuk tiga kategori hirarki yang dipertimbangkan sementara sebagian besar variasi dalam gen HSP70 terjadi dalam populasi.
        Kesimpulan: Ini adalah studi pertama yang menganalisis polimorfisme HSP70 pada ayam asli di Afrika dan hasil yang diperoleh harus membuka jalan bagi studi mendalam lebih lanjut tentang stres panas.

Download Jurnal Disini
Jurnal

Polimorfisme genetik pada protein heat-shock protein 70 dan variasi d-loop DNA mitokondria: implikasi pada pemilihan stres panas pada ayam asli di Kenya

Leave a reply "Jurnal Internasional Polimorfisme genetik pada protein heat-shock protein 70 dan variasi d-loop DNA mitokondria: implikasi pada pemilihan stres panas pada ayam asli di Kenya"

Author: 
    author