Jurnal Internasional Perbandingan urutan genom melalui ekstraksi proyeksi pada mixer virtual

Download Jurnal Disini

Untuk membandingkan beberapa urutan genom, kami mengubah setiap urutan genom primer menjadi vektor berbasis k-mer yang sesuai. Menurut prinsip analisis komponen independen (ICA), operasi dapat dianggap sebagai pencampuran beberapa sinyal genom sumber melalui beberapa sensor, di mana kita dapat memperoleh vektor campuran dengan panjang yang sama dari urutan genom yang sesuai dengan panjang yang berbeda. Namun, operasi pencampuran ini dilakukan dengan menghitung semua frekuensi berbasis k-mer, daripada menggunakan perangkat keras sensor yang sebenarnya. Jadi, kami beri nama operasi preprocessing ini sebagai virtual mixer (VM). Dengan menggunakan transformasi berbasis ICA, kami memproyeksikan semua vektor pada komponen independen mereka untuk menangkap vektor fitur berbasis koefisien melalui extract extractor (PE), yang telah terbukti memiliki properti menjaga jarak. Kemudian, kami menggunakan model VMPE yang diusulkan pada tiga rangkaian data nyata dari rangkaian genom untuk menguji efisiensi untuk model. Hasil analisis kontrastif menunjukkan bahwa model VMPE yang diusulkan berkinerja baik dalam analisis kesamaan.

Download Jurnal Disini
Jurnal

Perbandingan urutan genom melalui ekstraksi proyeksi pada mixer virtual