Jurnal Internasional Isolasi dan karakterisasi retrotransposon Ty1-copia di Saccharum officinarum

Download Jurnal Disini

Latar belakang. Saccharum officinarum adalah sumber yang paling signifikan untuk gula dan gen hasil tinggi dalam program pemuliaan tebu. Namun, informasi yang tidak diketahui dari evolusi dan organisasi genom sebagian besar tetap berada di tebu, yang memiliki kemajuan terbatas dalam pembiakan tebu. Retrotransposons menempati sebagian besar genom tanaman; Oleh karena itu, karakterisasi retrotransposons Ty1-copia akan meningkatkan pemahaman tentang evolusi dan organisasi genom tanaman.
        Metode. Penelitian ini mengisolasi domain-domain yang diawetkan dari gen-gen reverse transcriptase tiruan-retrotransposon Ty1-copia dari S. officinarum untuk mengkarakterisasi keragaman filogenetik, kelimpahan genomik, dan distribusi kromosom.
        Hasil. Secara total, 42 seri reverse transcriptase Ty1-copia dengan kemiripan 35-100% dan tingkat heterogenitas yang tinggi diperoleh. Dari mereka, 11 (26%) terganggu oleh kodon stop dan / atau mutasi frameshift. Analisis filogenetik mengungkapkan urutan ini dapat dibagi menjadi empat garis evolusi yang berbeda (Tork / TAR, Tork / Angela, Sire / Maximus, dan Retrofit / Ale). Analisis dot blot menunjukkan bahwa Ty1-copia retrotransposons mewakili bagian signifikan dari genom S. officinarum, dengan jumlah salinan setinggi 1,7×105. Fluoresensi in situ hibridisasi mengungkapkan bahwa Ty1-copia retrotransposons tersebar di dalam daerah heterokromatik di antara semua S. officinarum kromosom, dengan sekitar 30 sinyal yang jelas bergerombol di wilayah terminal. Namun, retrotransposons Ty1-copia tidak ditemukan di daerah pengorganisasian nukleus dari 45S rDNA.
        Diskusi. Hasil ini berfungsi untuk meningkatkan pemahaman kita tentang distribusi kromosom dan evolusi genom S. officinarum serta mempromosikan kemungkinan pemanfaatan retrotransposon dalam program pemuliaan tebu.

Download Jurnal Disini
Jurnal

Isolasi dan karakterisasi retrotransposon Ty1-copia di Saccharum officinarum