Jurnal Internasional Integrasi proteomik dan data metabolomik dalam model knock out sel baru dari methylmalonic acidemia

Download Jurnal Disini

Latar belakang. Methylmalonic acidemia adalah kesalahan metabolisme bawaan yang disebabkan oleh mutasi pada gen metilmalonil − CoA mutase (MUT). Sebagai perantara metabolisme propionat, MUT mengubah methylmalonyl − CoA menjadi succinyl − CoA, yang memasuki siklus Krebs. Kekurangan MUT Hilir, asam methylmalonic terakumulasi dalam cairan tubuh sebagai biomarker penyakit. Komplikasi jangka panjang dari penyakit ini dapat termasuk gangguan kognitif dan neurologis, penyakit ginjal kronis, gagal hati, dan kematian.
        Metode. Dalam rangka menciptakan model seluler yang valid untuk mempelajari penyakit, gen MUT tersingkir (KO) dalam sel HEK293 dengan menggunakan teknologi CRISPR-CAS9. Asam methylmalonic diukur dalam MUT-KO dan wild type (WT) sel dengan beberapa pemantauan reaksi. Analisis proteomik kuantitatif dilakukan menggunakan pendekatan berbasis spektrometri massa tanpa label. Data diolah menggunakan perangkat lunak MaxQuant. Selain itu, analisis metabolomik yang ditargetkan dilakukan untuk mengukur seluruh panel asam amino dan acylcarnitines.
        Hasil. Asam methylmalonic menghasilkan peningkatan sel KO jika dibandingkan dengan yang WT. Dataset proteomik menunjukkan sejumlah 69 protein yang diekspresikan secara diferensial, dimana 39 diatur turun dan 30 diatur dalam kondisi MUT-KO. Analisis Ontologi gen mengungkapkan pengayaan dalam kategori energi dan metabolisme lipid. Variasi dalam profil metabolik adalah indikasi perubahan dalam proses oksidasi asam lemak dan metabolisme lipid.

Download Jurnal Disini
Jurnal

Integrasi proteomik dan data metabolomik dalam model knock out sel baru dari methylmalonic acidemia