Jurnal Internasional IJMS, Vol. 19, Halaman 3542: Analisis Metilasi DNA dari Rilis Dormansi pada Tunas Bunga Almond (Prunus dulcis) Menggunakan Epi-Genotyping dengan Sequencing

Download Jurnal Disini

IJMS, Vol. 19, Halaman 3542: Analisis Metilasi DNA dari Rilis Dormansi di Almond (Prunus dulcis) Kuncup Bunga Menggunakan Epi-Genotyping oleh Sequencing

Jurnal Internasional Ilmu Molekuler doi: 10.3390 / ijms19113542

Penulis:
Ángela S. Prudencio
Olaf Werner
Pedro J. Martínez-García
Federico Dicenta
Rosa M. Ros
Pedro Martínez-Gómez

Metilasi DNA dan modifikasi pasca-translasi histone telah digambarkan sebagai mekanisme regulasi epigenetik yang terlibat dalam transisi perkembangan pada tanaman, termasuk perubahan musiman pada pohon buah. Dalam spesies seperti almond (Prunus dulcis (Mill.) D.A: Webb), paparan yang terlalu lama terhadap suhu dingin diperlukan untuk pembebasan dormansi dan pembungaan. Bertujuan untuk mengidentifikasi daerah genomik dengan keadaan metilasi diferensial sebagai respons terhadap akumulasi dingin, kami melakukan pengurutan genom sekuensing tereduksi Illumina pada DNA yang diobati dengan bisulfit dari kuncup bunga. Untuk melakukan hal ini, kami menganalisis genotipe almond dengan persyaratan pendinginan yang berbeda dan waktu pembungaan baik sebelum dan sesudah pembebasan dormansi selama dua tahun berturut-turut. Penelitian ini dilakukan menggunakan epi-Genotyping oleh Sequencing (epi-GBS). Sebanyak 7317 fragmen disekuensing dan sampel dibandingkan. Dari fragmen-fragmen ini, 677 diidentifikasi sebagai metilasi diferensial antara genotipe almond. Pemetaan fragmen-fragmen ini menggunakan genom Prunus persica (L.) Batsch v.2 sebagai referensi memberikan informasi tentang wilayah pengkodean yang terkait dengan penanda metilasi berbunga awal dan akhir. Selain itu, keadaan metilasi dari sepuluh urutan gen-coding ditemukan terkait dengan proses pembebasan dorman.

Download Jurnal Disini
Jurnal

IJMS, Vol. 19, Halaman 3542: Analisis Metilasi DNA dari Rilis Dormansi pada Tunas Bunga Almond (Prunus dulcis) Menggunakan Epi-Genotyping dengan Sequencing

Leave a reply "Jurnal Internasional IJMS, Vol. 19, Halaman 3542: Analisis Metilasi DNA dari Rilis Dormansi pada Tunas Bunga Almond (Prunus dulcis) Menggunakan Epi-Genotyping dengan Sequencing"

Author: 
    author