Jurnal Internasional Genomik interaksi host-patogen: tantangan dan peluang lintas skala ekologis dan spasial

Download Jurnal Disini

Genomik evolusioner baru-baru ini memasuki era baru dalam studi interaksi host-patogen. Berbagai teknik genomik baru telah berubah menjadi identifikasi, deteksi, dan klasifikasi kedua host dan patogen, memungkinkan resolusi yang lebih besar yang membantu menguraikan dinamika dasar mereka dan memberikan wawasan baru ke dalam konteks lingkungan mereka. Namun demikian, banyak tantangan untuk pemahaman umum tentang interaksi inang-patogen tetap, khususnya dalam sintesis dan integrasi konsep dan temuan di berbagai sistem dan skala spatiotemporal dan ekologi yang berbeda. Dalam perspektif ini kami bertujuan untuk menyoroti beberapa kesamaan dan kompleksitas di berbagai studi interaksi host-patogen, dengan fokus pada variasi ekologi, variasi spasial, dan pilihan metode genomik yang digunakan. Kami melakukan tinjauan kuantitatif literatur terbaru untuk menyelidiki hubungan, pola, dan potensi pertukaran antara kompleksitas skala genomik, ekologis, dan spasial yang dilakukan dalam studi patogen-inang individu. Kami menemukan bahwa mayoritas penelitian menggunakan resolusi genom keseluruhan untuk mengatasi tujuan penelitian mereka di berbagai skala ekologi, terutama ketika berfokus pada sisi patogen interaksi. Namun demikian, studi genomik yang dilakukan dalam konteks spatiotemporal yang kompleks saat ini jarang dalam literatur. Karena proses interaksi host-patogen dapat dipahami pada berbagai skala, dari skala molekuler, seluler, dan fisiologis ke tingkat populasi dan ekosistem, kami menyimpulkan bahwa hambatan utama untuk sintesis di berbagai sistem host-patogen adalah bahwa data dikumpulkan pada skala yang sangat beragam dengan berbagai tingkat resolusi. Perbedaan ini tidak hanya menghambat organisasi infrastruktur yang efektif dari data tetapi juga granularitas dan aksesibilitas data. Metadata komprehensif yang disimpan dalam hubungan dengan data genom dalam basis data yang mudah diakses akan memungkinkan inferensi yang lebih besar di seluruh sistem di masa depan, terutama ketika dikombinasikan dengan standar dan praktik data terbuka. Standarisasi dan komparabilitas data tersebut akan memfasilitasi deteksi dini penyakit menular yang muncul serta studi tentang dampak stresor antropogenik, seperti perubahan iklim, pada dinamika penyakit pada manusia dan satwa liar.

Download Jurnal Disini
Jurnal

Genomik interaksi host-patogen: tantangan dan peluang lintas skala ekologis dan spasial

Leave a reply "Jurnal Internasional Genomik interaksi host-patogen: tantangan dan peluang lintas skala ekologis dan spasial"

Author: 
    author