Jurnal Internasional Gen, Vol. 9, Halaman 588: Analisis Sistem Profil Transkriptomik dan Proteomik Mengidentifikasi Peraturan Baru Program Fibrotik oleh miRNA di Fibrosis Paru Fibroblas

Download Jurnal Disini

Gen, Vol. 9, Halaman 588: Analisis Sistem Profil Transkriptomik dan Proteomik Mengidentifikasi Peraturan Baru Program Fibrotik oleh miRNA di Fibrosis Paru Fibroblast

Gen doi: 10.3390 / genes9120588

Penulis:
Steven Mullenbrock
Fei Liu
Suzanne Szak
Xiaoping Hronowski
Benbo Gao
Peter Juhasz
Chao Sun
Mei Liu
Helen McLaughlin
Qiurong Xiao
Carol Feghali-Bostwick
Timotius S. Zheng

Fibroblast / myofibroblast adalah sel efektor utama yang bertanggung jawab untuk deposisi matriks ekstraseluler (ECM) berlebihan dan perkembangan fibrosis pada kedua fibrosis paru idiopatik (IPF) dan paru-paru pasien sistemik sclerosis (SSc), sehingga sangat penting untuk memahami transkriptomik dan proteomik program yang mendasari aktivitas fibrogenik mereka. Kami melakukan analisis integratif pertama dari pemrograman fibrotik dalam sel-sel ini pada tingkat ekspresi gen dan mikroRNA (miRNA), serta protein ECM yang dideposit untuk mendapatkan wawasan tentang bagaimana program transkripsi fibrotik berujung pada produksi / deposisi protein ECM yang menyimpang. Kami mengidentifikasi messenger RNA (mRNA), miRNA, dan menyetor tanda-tanda protein matrisome untuk IPF dan fibroblas SSC yang diperoleh dari transplantasi paru menggunakan sequencing generasi berikutnya dan spektrometri massa. Tanda tangan transkripsi SSC dan IPF fibroblast sangat mirip, dengan pengayaan gen WNT, TGF- & amp; beta, dan ECM. miRNA-seq mengidentifikasi miRNA yang diatur secara berbeda, termasuk downregulation miR-29b-3p, miR-138-5p dan miR-146b-5p dalam fibroblast penyakit dan transfeksi dari meniru mereka menurunkan ekspresi set berbeda dari gen signature fibrotik yang dinilai menggunakan Nanostring panel fibrosis. Akhirnya, analisis proteomik menemukan perbedaan & amp; ldquo; fibrotik & amp; rdquo; profil matrisome disimpan oleh IPF dan fibroblas SSc dibandingkan dengan kontrol yang menyoroti produksi ECM yang tidak diatur yang mendasari aktivitas fibrogenik mereka. Analisis komprehensif kami dari mRNA, miRNA, dan profil proteomik matrisome pada fibroblas paru IPF dan SSC mengungkapkan tanda fibrotik yang kuat baik pada tingkat gen dan ekspresi protein dan mengidentifikasi miRNA terkait fibrogenesis baru yang menyimpang downregulation pada fibroblas penyakit kemungkinan berkontribusi pada fibrotik dan ECM mereka. ekspresi gen.

Download Jurnal Disini
Jurnal

Gen, Vol. 9, Halaman 588: Analisis Sistem Profil Transkriptomik dan Proteomik Mengidentifikasi Peraturan Baru Program Fibrotik oleh miRNA di Fibrosis Paru Fibroblas

Leave a reply "Jurnal Internasional Gen, Vol. 9, Halaman 588: Analisis Sistem Profil Transkriptomik dan Proteomik Mengidentifikasi Peraturan Baru Program Fibrotik oleh miRNA di Fibrosis Paru Fibroblas"

Author: 
    author