Jurnal Internasional Diseksi tiga lokus sifat kuantitatif untuk ukuran butir pada lengan panjang kromosom 10 dalam beras (Oryza sativa L.)

Download Jurnal Disini

Latar Belakang
Berat seribu butir adalah komponen utama hasil gabah dalam beras, dan sifat yang terkait erat dengan panjang gabah (GL) dan lebar gabah (GW) yang merupakan sifat penting untuk kualitas gabah. Gen-gen kausal untuk 16 lokus sifat kuantitatif (QTL) yang mempengaruhi sifat-sifat ini telah dikloning, tetapi lebih banyak QTL yang masih harus dikarakterisasi untuk membangun jaringan pengatur genetik. Sebuah QTL yang mengendalikan ukuran butir dalam beras, qGS10, sebelumnya dipetakan dalam interval RM6100 – RM228 pada kromosom 10. Penelitian ini bertujuan untuk membatasi QTL ini ke lokasi yang lebih tepat.

metode
Sebanyak 12 populasi digunakan. Populasi ZC9 terdiri dari 203 keluarga S1: 2 yang berasal dari sisa tanaman heterozigot (RH) pada generasi F9 dari persilangan padi indica Teqing (TQ) / IRBB52, yang memisahkan wilayah atas RM6100 – RM228 dan tiga daerah lagi pada kromosom 1, 9, dan 11. Populasi Ti52-1 terdiri dari 171 pabrik S1 yang berasal dari satu pabrik RH di F7 dari TQ / IRBB52, memisahkan satu interval yang berada di bagian bawah RM6100-RM228. Sepuluh populasi lainnya semuanya berasal dari Ti52-1, termasuk lima populasi S1 dengan wilayah segregasi sekuensial yang mencakup wilayah target dan lima populasi garis isogenik dekat (NIL) yang mempertahankan pola segregasi yang sama. Analisis QTL untuk berat 1.000 butir, GL, dan GW dilakukan menggunakan QTL IciMapping dan prosedur SAS GLM.

Hasil
Tiga QTL dipisahkan di wilayah qGS10 asli. The QGL10.1 terletak di wilayah atas RM6704 – RM3773, terbukti hanya mempengaruhi GL. The QGS10.1 terletak dalam interval 207.1-kb diapit oleh penanda InDel Te20811 dan Te21018, memiliki efek yang stabil dan relatif tinggi pada ketiga sifat yang dianalisis. The QGS10.2 terletak dalam interval 1,2-Mb diapit oleh penanda pengulangan urutan sederhana RM3123 dan RM6673. QTL ini juga memengaruhi ketiga sifat tersebut, tetapi efeknya tidak konsisten di berbagai eksperimen. QTL untuk ukuran butir juga terdeteksi di ketiga wilayah pemisah lainnya.

Kesimpulan
Tiga QTL untuk ukuran butir yang terkait erat pada lengan panjang kromosom 10 beras dipisahkan menggunakan populasi NIL dengan daerah pemilahan berurutan. Salah satunya, qGS10.1, memiliki efek stabil dan relatif tinggi pada berat biji-bijian, GL, dan GW, memberikan kandidat yang baik untuk kloning gen. QTL lain, qGS10.2, memiliki efek yang signifikan pada ketiga sifat tetapi efeknya tidak konsisten di berbagai eksperimen, memberikan contoh interaksi genotipe-oleh-lingkungan.

Download Jurnal Disini
Jurnal

Diseksi tiga lokus sifat kuantitatif untuk ukuran butir pada lengan panjang kromosom 10 dalam beras (Oryza sativa L.)