Jurnal Internasional Aplikasi uji identifikasi spesies PCR-RFLP untuk deteksi DNA lingkungan

Download Jurnal Disini

Kemajuan terbaru dari metode eDNA untuk mensurvei spesies dalam ekosistem perairan telah digunakan untuk berbagai organisme dan berkontribusi pada pemantauan dan konservasi spesies dan lingkungan. Amfibi adalah salah satu taksa yang menjanjikan yang dapat dipantau secara efisien dengan menggunakan eDNA. Namun, biaya deteksi eDNA bisa sangat tinggi dan membutuhkan instrumen yang biasanya tidak dipasang di laboratorium ekologi. Untuk membantu para peneliti melakukan studi eDNA tentang amfibi, terutama yang tidak berspesialisasi dalam biologi molekuler, kami mengembangkan protokol hemat biaya menggunakan metode PCR-RFLP. Kami berupaya mendeteksi eDNA dari tiga spesies Rana Jepang (R. japonica, R. ornativentris, dan R. tagoi tagoi) dalam berbagai skala spasial termasuk area yang dekat dengan Pembangkit Listrik Tenaga Nuklir Fukushima (FNPP) di mana lingkungan pulih setelah bencana pada tahun 2011. Protokol PCR-RFLP kami berhasil mendeteksi spesies Rana dalam air statis baik di laboratorium maupun di lapangan; Namun, ia tidak dapat mendeteksi spesies Rana dalam sampel air non-statis dari lapangan. Bahkan metode deteksi yang lebih sensitif (qPCR standar) tidak dapat mendeteksi katak di semua sampel air non-statis. Kami berspekulasi bahwa protokol baru kami efektif untuk katak yang tinggal di habitat lentik, tetapi tidak untuk habitat lotus yang mungkin masih membutuhkan standar emas pengamatan lapangan untuk pendekatan deteksi.

Download Jurnal Disini
Jurnal

Aplikasi uji identifikasi spesies PCR-RFLP untuk deteksi DNA lingkungan