Jurnal Internasional Analisis deskriptor molekul independen GRID dan studi docking molekuler untuk meniru hipotesis pengikatan am-aminobutyric acid transporter 1 (GAT1) inhibitor

Download Jurnal Disini

Latar Belakang
Transporter asam γ-aminobutyric (GABA) GAT1 terlibat dalam transpor GABA melintasi membran biologis masuk dan keluar dari celah sinaptik. Efisiensi transport GABA yang ditambah Na + ini diatur oleh gradien elektrokimia, yang diarahkan ke dalam kondisi normal. Namun, dalam situasi patofisiologis tertentu, termasuk depolarisasi kuat atau ketidakseimbangan homeostasis ion, masuknya GABA ke dalam sitoplasma meningkat dengan mengambil kembali mekanisme transportasi. Mekanisme ini dapat menyebabkan penghapusan ekstra GABA ekstraseluler yang menghasilkan berbagai gangguan neurologis seperti epilepsi. Dengan demikian, inhibitor molekul kecil pengambilan kembali GABA dapat meningkatkan aktivitas GABA di celah sinaptik.

Metode
Dalam penelitian ini, berbagai model deskriptor molekul-independen GRID (GRIND) telah dikembangkan untuk menjelaskan fitur struktural 3D dari penghambat GAT1 manusia (hGAT1) menggunakan asam nipecotic dan analog N-diarylalkenyl piperidine. Selanjutnya, hipotesis yang mengikat telah dikembangkan untuk antagonis GAT1 yang dipilih oleh docking molekuler di dalam rongga yang mengikat model homologi hGAT1.

Hasil
Hasil kami menunjukkan bahwa dua akseptor ikatan hidrogen, satu donor ikatan hidrogen dan satu daerah hidrofobik pada jarak tertentu dari satu sama lain memainkan peran penting dalam mencapai potensi penghambatan tinggi terhadap hGAT1. Hasil docking kami menjelaskan pentingnya gugus COOH dalam antagonis hGAT1 dengan mempertimbangkan substitusi gugus COOH dengan cincin isoxazol dalam senyawa 37, yang kemudian mengarah pada penurunan orde tiga urutan dalam aktivitas biologis 37 (IC50 = 38 µM) sebagai dibandingkan dengan senyawa 1 (IC50 = 0,040 μM).

Diskusi
Hasil docking kami diperkuat oleh hubungan aktivitas struktur seri data serta model GRIND, sehingga memberikan dasar struktural yang signifikan untuk memahami pengikatan antagonis, yang mungkin berguna untuk memandu desain hGAT1 inhibitor.

Download Jurnal Disini
Jurnal

Analisis deskriptor molekul independen GRID dan studi docking molekuler untuk meniru hipotesis pengikatan am-aminobutyric acid transporter 1 (GAT1) inhibitor

Leave a reply "Jurnal Internasional Analisis deskriptor molekul independen GRID dan studi docking molekuler untuk meniru hipotesis pengikatan am-aminobutyric acid transporter 1 (GAT1) inhibitor"

Author: 
    author